Может у вас когда-то в сети АТС уже была группа с этим индексом? Пробовали действовать радикально:
1. Удалить плату INTIP  и создать заново (лучше на другом месте)? или,
2. Создавать Транковую группу с другим индексом (следить внимательно при создании за параметром node number)?  

А в netadmin прописаны все имена и адреса?

В этом случае на вход работает 45 NPD. Название не критично.

Если в TG прописан 45 NPD, то с ним и нужно работать, исключение -использование ARS для исходящих звонков. Где вы взяли ссылку на 40 NPD  из вашего примера?
NPD работает как для входящей, так и для исходящей связи одновременно.  За это отвечают DID трансляторы; Called- входящий, Calling/Connected - исходящий, как вы сами и поняли.

В настройке почты надо будет указать новый адрес физического процессора.

По вашему конкретному примеру:
установите параметр Install. number source + NPD source
появится дополнительная строка где вы сможете поставить требуемые дополнительные 4 знака к вашему номеру. Скорее всего, это код города.
А сколько цифр вам присылает оператор для входящей связи?

Барабашка.. Станция должна выдавать сообщение о выходе терминала из строя. Либо надо менять патч. Возможно ли воткнуть проблемный аппарат непосредственно рядом со станцией, минуя трассу/СКС?

Сам по себе инцидент может и не страшен, но лучше вывести аппарат в соответствие по менеджменту. Также, бывает, что аппарат не подхватывает файлы из версии ОХЕ, а свои загруженные файлы явно старее. Посмотрите..

А что говорят инциденты?  

Что у ARS, что у транковой группы есть параметр NPD. NPD описывает, какие цифры будет обрабатывать транковая группа при входе и какое будет номероопределение при исходящем звонке. Если в ARS в поле NPD стоят конкретные номера типа с 1 до 45 (или более), то править нужно именно этот NPD, находится в ARS route list. Если типа -1,255, то править нужно NPD транковой группы, trunk group NPD selector. Сами NPD находятся в Translator\External Numbering Plan(scheme). Объяснять как работает-лучше почитать доку. Еще можно почитать эту тему, тоже поможет.

Изменить эти данные с помощью 4760 у вас не получится. Надо заходить через консольный порт и использовать для этого определенные внутренние приложения (netadmin для CS и mgconfig для GD). Объяснять  как ими пользоваться долго и нудно. Лучше читать доки. Далее, после смены адресов, если вы используете 4760i, вам нужно будет переустановить её.

Аппарат не параллелится. Надо создавать 2 аппарата с отдельными номерами. Можно сделать тандем либо hunt. group или у аппарата в режиме multi-line прописать дополнительные клавиши set supervision со звонком.

Это уже дебри. У вас должна быть транковая группа с IP специализацией -SIP. Она же прописана в SIP Gateway. Для большей глубины лучше почитать документацию..  Можете поставить G711 и посмотреть, что происходит.

Trunk Groups/ trunk group - ip compression type. Где-то ближе к низу..

Посмотрите подменю вашей транковой группы тип компресии (с компресией или без).  Уберите default.