А какие кластеры были закрыты, если не секрет. При нормальном порядке менеджмента - ничего не должно остаться закрытым.

С VPN префиксами - у вас похоже тоже все плохо. Вы ссылаетесь в VPN префиксах на ARS лист - но в ARS листе у вас не написано - как звонить на данный префикс.

По моему разумению:
- надо было делать multi-access hybrid link.
- Прописывать в нем два доступа (например два main) - один D-channel (от E1) и к нему прописать транки (TS от E1).
- Второй IP.

Если требуется хождение голоса по IP - то соответственно делать VPN overflow (supervised by routing, VPN overflow, VPN overflow префиксы и разрешение на VPN).

Тут у вас как-то все вопросы в кучу - и линк гибридный и переход с Е1 на IP.
1 - вы не пытаетесь в одном направлении сделать и ABC-F линк и Hybrid link?
2 - сделали конечно наверное по документации - но как мы это можем увидеть? вдруг вы ошиблись. Например в одной стороны поставили multi-access=yes, с другой no.
Или на новой станции, после задания номеров сети/узлов (в netadmin и в System) - не рестартовали станцию. И т.п.

Вопрос - вы не пробуете поставить плату как INT-IP3A, но воткнуть ее в гнездо предназначенное для процессоров (и соответственно INT-IP3B).

/DHS3bin/downbin/intip3/binintip3    

Invalid translator number - создаете существующий номер.
В трансляторе - префикс для SD (direct) - создавать не надо.    

Security по сети - поднято или нет?
С IP адресами и пр. - все нормально? С процессора INT-IP пингуется (в то время когда пытается загрузиться)?
На процессоре - есть инциденты?  

Платы - ремонтировать (или отдавать в ремонт, если самим не удалось). Покупать отремонтированные.
Там обычно (насколько помню) - неисправности типовые были - диоды/транзисторы в цепи одного из питаний.

Лень лезть искать, но обычно 4760/8770 позволяли поставить "следующий" релиз ПО, но без открытия нового функционала.

Скорее - перезаливка ПО. Site specific data - это что вы делаете в netadmin (адреса, имена, и т.п.), swinst (автостарт, тайм-зоны...), во многих случаях не восстанавливал его.

Вариаций не много - сохраненная база побита. Что-то с ПО (ошибки, криво встало).
Можно попробовать ради интереса - взять 7-zip и развернуть архив на компе - тоже сругается?

И да, как Влад написал - создавать базу и ставить OPS - не надо. Т.к. OPS - это файлы лежащие в базе. Сохранение новой базы - начинается с удаления старой.

Модули - ничего не запускают. Они просто формируют напряжения, которые нужны для работы и для перепрограммирования флеш.
Вполне выпаиваемы (с отсосом) и ремонтопригодны.

Вы про какие модули питания, которые запускают обновление прошивки?
Обновление прошивки запускается - когда версии софта на диске и во флеш отличаются. Были проблемы с установкой плат из новых релизов в старые.
Или у вас - какие-то питания отсутствовали ? Тогда можно просто ремонтировать эти блочки. Они вполне ремонтопригодны.

А зачем вам удалять и создавать лист (в этом случае естественно - не позволит удалить, то, что еще где-то прописано)?
Вы ведь хотели просто номер поменять.