Я бы для начала позвонил с проблемных и не проблемных абонентов на обычный аппарат и понабирал - хотя бы акустически сравнив набор - уровень и рвется/не рвется.

По идее номер должен быть там где вы и ищите - X25/ X25 numbering, только еще дальше - X25 numbering plan.
И небольшая просьба - если особой необходимости нет - отвечайте просто, без цитирования, легче читать.

Еще раз повторюсь - наличие двух абонентов с одинаковыми номерами на разных узлах - это не препятствие для аудита.
Например узел 1 - абоненты 100 - 200, узел 2 - абоненты 200 - 299.
При проведении аудита на узле 1 (построение базы) - будет сообщение как у вас, но для абонентов 201 - 299 будут созданы Network номера (кроме естественно 200). При расылке базы по узлу 2 будет аналогичное сообщение, но нетворк номера 100 - 199 будут созданы.
А ваш Е000000 - надо искать не в Х25 кластерах, а в Х25/ план нумерации.

Несмотря на отпуск и болезнь внесу своих два цента- то что Е000000 присутствует на двух узлах - это не мешает аудиту по всему остальному (т.е. это не препятствие для аудита).
Тем не менее если хотите  - посмотрите в X25 плане нумерации и X25 асcess кластере 0-м. Начиная с R3 - в пойнтах перестали прописывать X25 адреса (Е000000 и т.п.).
Если в 0-м кластере в пойнтах прописаны адреса - можно остановить пойнты и поменять адреса.
Если как я предполагаю в 108 (132 и т.п.) пойнтах нет указания X25 адреса - предлагаю просто игнорировать данное сообщение.

Для абонентских комплектов System/ Z board audio parameters.
И поверьте - дешевле выкинуть старые аппараты. Хотя я не встречал проблем, кроме аппаратов, где центробежный регулятор был откровенно умерший.

Что-то вам Генезис голову дурит. При входящем звонке обычно АОН не переделывается, город вам соответственно +7 дать не может. Кроме того - а если звонят из Германии и т.п. - "+49" ВЫ должны поставить?
Рекомендую данный вопрос на Анлеашед продублировать, тов Ковагнаро из Чили поточнее ответит, он обычно на вопросы о Генезисе оперативно реагирует.

Параметры берутся из категории сигнализации указанной в транке.
Далее в external services/ Trunk COS после строчки указания что набор декадный - идут собственно параметры замыкания и размыкания. Собственно для России например 60/40. Для АБОНЕНТА этот параметр смысла не имеет, для транка - можеть быть. Если шелфы не разбросаны по разным странам - делаете менеджмент как требуется вам (по законам страны). А после нагибаете оператора.
Можно использовать несколько категорий, с разными параметрами набора (по умолчанию - штуки 4-е вроде созданы).

Забавный документ, в официальном документе "OXE_R9.1_Product_Limits_8AL020033568DRASA.xls" про это правда не сказано. Но будем иметь в виду.

Может у них к станции подключена ВНЕШНЯЯ система коференцсвязи - типа Ассамблеи (Диалоджиковская плата в комп + софт)

судя по названию - архив. Я так понимаю кладем на линуксовую машину и разархивируем.

Вариантов 2, правильный:
Снимаете ОХО файл с реального сайта.
Менее правильный - правите hardware.mao файл в zip файле.

насчет превращения 31 в 8 - это туфта. В любом случае рекомендации возможны только при понимании вашей топологии (логической и физической).
Далее - при словах про 1000 - вы действительно хотите поднять такую единую сеть? Если это станции не из 10 абонентов - Алкатель бы пошел вам на встречу.

С trunk COS было интересно биться, когда линии в OS уходили

А что значить "не на всех городских АТС"? Вы полку по городу таскаете и втыкаете в разные станции?
CLIP включена?

Только не уловил, что значить "должно работать не только через DISA"?
Вы снаружи можете пользоваться кодами ДВО только после подстановки  - а это только через DISA (или remote extention - но это по сути автоматическая подстановка через DISA).
А как абоненты ХОТЯТ набирать - это конечно интересно, но зачастую проблема решается, если им говорят - набирать НАДО так!
Чего сложного в наборе префикса и (после подсказки) наборе пароля? Внутренние ведь набирают так-же и ничего. Если чего-то хочется уменьшить - уменьшите длину кода (в Spec. telephone services).