Добрый день! Ваши вопросы смахивают на вопрос "Как завоевать с ходу половину мира?". Ответы конкретные дать затруднительно. Если тезисно:
Проверка состояния диска - команда smartctl -a /dev/hda. запускается из-под root(su).
Сделанные копии конфигурации  (через swinst-expert menu- backup&restore operations), хранятся  в директории usr4/BACKUP/IMMED. Можно забирать по FTP.
C ЗИП-ом беда, особенно для старых станций.
На резервных дисках лучше уже иметь устанновленную версию ПО станции.

Как-то так. Детальное описание процедур занимает слишком много времени. Лучше найти для проработки необходимую литературу.